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종합소득세

가게를 하나 더 열면 사업자등록을 또 내야 하나요?

“두 번째 매장을 여는데 등록을 따로 하나요?”

“신고도 두 번 하나요?”

“매출 기준은 합쳐서 보나요?”

사업장이 늘어나면 «등록»과 «신고»와 «판정»이 각각 다르게 움직입니다. 등록은 사업장마다, 신고는 총괄할 수 있고, 기장의무 같은 판정은 항목마다 기준이 다릅니다.

핵심 요약

사업자등록은 사업장마다 하는 것이 원칙이며, 사업자단위과세자가 아니면 각각 별도로 등록합니다.

사업자단위과세로 등록하면 본점 등에서 총괄하여 신고·납부할 수 있습니다.

기장의무는 공동사업장과 단독사업장을 각각 판정하고, 의제매입세액 한도는 사업자단위과세자 전체의 과세표준을 기준으로 봅니다.

이 글에서 다루는 것
  1. 01. 등록은 어떻게 하나요?
  2. 02. 사업자단위과세는 어떻게 등록하나요?
  3. 03. 사업장을 옮기거나 바꾸면요?
  4. 04. 기장의무는 합쳐서 판정하나요?
  5. 05. 세액 계산의 한도는 어떻게 보나요?
  6. 06. 성실신고확인은 어떻게 되나요?

01. 등록은 어떻게 하나요?

사업자등록은 사업장마다 하는 것이 원칙이며, 사업자단위과세란 둘 이상의 사업장을 가진 사업자가 본점 등에서 총괄하여 신고·납부할 수 있도록 하는 제도를 말합니다.

국세청은 «사업자단위과세자»가 아닌 경우 사업장이 여럿이면 각각의 사업장마다 별도로 사업자등록을 하여야 한다고 안내합니다 부가가치세법 §8 · 2026-09.

02. 사업자단위과세는 어떻게 등록하나요?

동일한 사업자에게 2 이상의 사업장이 있는 경우로서, 해당 사업자의 본점 등을 관할하는 세무서장에게 사업자단위과세자로 등록한 사업자는 그 본점 등에서 총괄하여 신고·납부할 수 있습니다.

사업자단위과세 등록 시기와 서식
상황등록 시기서식
본점 또는 주사무소를 포함하여 2 이상의 사업장을 신규로 개설하면서 적용받으려는 경우사업개시일로부터 20일 이내에 본점 또는 주사무소 관할세무서장에게 등록사업자등록 신청서
기존사업자가 적용받으려는 경우과세기간 개시 20일 전까지 등록사업자단위과세 등록신청서

국세청 사업자단위과세 제도 · 2026-09

기존사업자는 시점이 다릅니다 신규 개설은 «사업개시일부터 20일 이내»이지만, 이미 사업 중인 경우는 «과세기간 개시 20일 전»입니다. 과세기간이 시작된 뒤에는 그 기간부터 적용받을 수 없으므로 미리 준비해야 합니다.

03. 사업장을 옮기거나 바꾸면요?

사업자단위과세사업자가 사업자단위 과세 적용사업장을 이전 또는 변경하는 것은 사업자등록 정정신고 사유로 별도 열거되어 있습니다. 재교부는 신청일로부터 2일 내입니다 부가가치세법 시행령 §14 · 2026-09.

04. 기장의무는 합쳐서 판정하나요?

항목에 따라 다릅니다. 공동사업이 섞인 경우 국세청은 사업장을 섞지 않고 각각 판정한다고 봅니다.

기장의무 판정 기준
구분판정 기준
공동사업장공동사업장의 총수입금액만으로 판정
단독사업장단독사업장의 총수입금액 합계액으로 판정

소득세 집행기준 43-0-2 · 2026-09

여기서 «단독사업장의 합계액»이라는 표현이 중요합니다. 혼자 하는 사업장이 여러 개면 그것들끼리는 합산하고, 공동사업장은 따로 본다는 뜻입니다.

05. 세액 계산의 한도는 어떻게 보나요?

사업장이 여럿일 때 «한도의 기준이 되는 과세표준을 어디까지로 보느냐»가 문제가 됩니다. 의제매입세액공제가 대표적입니다.

의제매입세액 공제 한도의 기준
구분한도 기준
사업자단위과세사업자사업자단위과세사업자 전체의 과세표준을 한도로 세액공제
총괄납부사업자제조장에서 공급한 과세표준과 직매장을 통해 판매한 과세표준을 합한 금액

국세청 상담사례(부가-86 · 법규과-422) · 2026-09

공장과 매장을 나누어 운영하면서 제조장 매출만으로 한도를 계산하면 한도가 실제보다 작아집니다. 직매장 판매분을 빠뜨리지 않아야 합니다.

06. 성실신고확인은 어떻게 되나요?

공동사업장과 단독사업장 중 어느 한 사업장만 성실신고확인 대상인 경우 신고기한은 다음 연도 6월 30일까지입니다. 다만 공동사업장 구성원 중 성실신고확인 대상에 해당하지 않는 사람은 5월 31일까지 신고해야 합니다 국세청 상담사례(소득세과-335) · 2026-09.

정리하면 ① 등록은 사업장마다(단위과세 선택 시 총괄) ② 신고·납부는 단위과세로 총괄 가능 ③ 기장의무 판정은 공동/단독을 나누어 ④ 세액 한도는 단위과세 전체 기준. 네 층위가 각각 다르게 움직입니다.
공신력 있는 자료로 확인하기 사업자단위과세는 국세청 누리집 «사업자등록 신청»에, 기장의무·성실신고 판정 사례는 국세상담센터 종합소득세 «공동사업»에 있습니다. 상담사례는 유권해석이 아닙니다.

07. 사업장 여러 곳, 자주 묻는 질문은 무엇인가요?

매장을 하나 더 열면 사업자등록을 또 내야 하나요?

사업자단위과세자가 아니라면 사업장이 여럿일 때 각각의 사업장마다 별도로 사업자등록을 해야 합니다.

신고도 사업장마다 따로 하나요?

사업자단위과세로 등록하면 본점 등에서 총괄하여 신고·납부할 수 있습니다.

사업자단위과세는 언제 등록하나요?

2 이상의 사업장을 신규로 개설하면서 적용받으려면 사업개시일부터 20일 이내, 기존사업자는 과세기간 개시 20일 전까지 등록합니다.

기장의무는 사업장 매출을 다 합쳐서 보나요?

공동사업장은 공동사업장의 총수입금액만으로, 단독사업장은 단독사업장의 총수입금액 합계액으로 각각 판정합니다.

의제매입세액 한도는 어느 매출로 계산하나요?

사업자단위과세사업자는 전체의 과세표준을 한도로 하고, 총괄납부사업자는 제조장 공급 과세표준과 직매장 판매 과세표준을 합한 금액을 기준으로 합니다.

한 사업장만 성실신고확인 대상이면 신고기한은요?

공동사업장 또는 단독사업장 중 어느 한 사업장만 대상이면 다음 연도 6월 30일까지입니다. 다만 공동사업장 구성원 중 대상이 아닌 사람은 5월 31일까지 신고합니다.

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김근희 세무사
국세청 출신 김근희 세무사

국립세무대학을 졸업하고 국세청에서 17년간 근무했습니다. 서울지방국세청 감사관실(감찰·감사)과 삼성세무서 법인세과·조사과, 잠실·송파·강동세무서 조사과, 국세청 법인납세국 소비세과를 거쳤습니다. 현재 세무법인봉정 성수지점 대표세무사로 개인사업자와 법인의 기장·신고부터 양도·상속, 세무조사 대응까지 맡고 있습니다.

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